號外！號外！基因測序的國際金標準——ABI3500一代測序儀于近日在廣東醫科大學順德婦女兒童醫院正式上線！低深度全基因組測序（即CNV-seq）也實現自行檢測！這標志著廣東醫科大學順德婦女兒童醫院基因測序技術力量再上新臺階！

基因測序的國際金標準

——ABI3500一代測序儀首次亮相

精準判斷羊水樣本是否存在母體污染

準媽媽們都知道，懷孕后需要對胎兒是否患染色體疾病做檢查。孕11~13周+6天的B超早篩和孕15~20周的唐氏血清學篩查以及無創DNA檢測都是篩查胎兒染色體疾病的重要方法。

如果這些篩查結果提示高風險，那么下一步就要做羊水穿刺來確診。高齡準媽媽們也總是被告知需要做羊水穿刺檢查。

但眾所周知，羊水穿刺是屬于有創取樣技術，存在母體細胞污染的可能。由于基因擴增的高度敏感性，即使微量的母體組織污染都可能干擾基因診斷結果，發生嚴重的臨床后果。因此，鑒定所取胎兒組織是否存在母體污染是產前診斷分子遺傳實驗室必需具備的鑒別技術。

廣東醫科大學順德婦女兒童醫院新購入的基因測序的國際金標準-----ABI3500一代測序儀“神器”，可以通過對比胎兒樣本和母親樣本STR（即短串聯重復序列）圖譜位點峰的來源，判斷異常是遺傳自父母還是取樣時母血污染導致的，繼而判斷樣本是否存在母血污染。

“ABI3500”一代測序儀首次亮相就輔助產前診斷中心快速診斷18號染色體三體胎盤嵌合一例、結合cnv-seq結果快速診斷2號染色體三體一例，輔助兒保科診斷發育異常的患兒為22q11綜合癥。上個世紀，“人類基因組計劃（基于一代測序）”、“曼哈頓原子彈”計劃和“阿波羅登月”計劃并稱為三大科學計劃，是人類科學史上的又一個偉大工程，被譽為生命科學的“登月計劃”。一代測序是目前所有基因測序的國際金標準。STR親子鑒定、法醫鑒定等也是基于此項技術。日后，廣東醫科大學順德婦女兒童醫院將依靠這一平臺我科將會開展更多單基因病測序分析，及其快速診斷胎兒染色體非整倍體、多重連接探針擴增技術（MLPA）等片段分析項目。

低深度全基因組測序（即CNV-seq）實現自行檢測

產前診斷變得更高效和精準

幾年前，大多數醫院的羊水穿刺都只能查染色體核型分析，它雖然是產前診斷的金標準，但畢竟有局限性。首先它需要把羊水細胞在體外培養10天左右的時間，待細胞大量增殖后經過一系列實驗過程制成玻片標本，然后由醫生在顯微鏡下進行計數和分析才能得出診斷結論。這個過程不僅費時費力，而且對實驗人員的技術要求高，特別是由于顯微鏡的分辨率有限，無法檢出染色體上6Mb以下微小片段的異常。

我們把染色體1kb至3Mb的微小片段又稱作拷貝數變異，一般縮寫成CNV。這些CNV重不重要呢？當然重要。其實由CNV導致的疾病是除染色體非整倍體以外引起新生兒出生缺陷的重要遺傳性疾病，大概有300多種，在新生兒中的發生率可以達到1/600，發生率比唐氏綜合征還高。所以準媽媽們如果要做羊水穿刺，醫生多半都會建議在染色體核型分析的同時做CNV檢測。

檢測CNV的基因測序方法又稱為CNV-seq，即低深度全基因組測序。隨著ABI3500一代測序儀的上線，廣東醫科大學順德婦女兒童醫院醫學遺傳實驗室可實現低深度全基因組測序自行檢測。低深度全基因組測序技術（CNV-seq）是基于低深度全基因組測序的新一代拷貝數變異檢測技術，可對多種類型的樣本如羊水、絨毛、臍帶血、流產組織、外周血等進行檢測，一次高效分析全基因組23對染色體的數目和結構異常。

我國出生缺陷發生率約為5.6%，每年新增出生缺陷約90萬列，而染色體畸變約占出生缺陷遺傳性病因的80%以上。已明確由致病性基因組拷貝數變異（pCNVs）所致的染色體微缺失/微重復綜合征已達300多種，綜合發病率近2-3%，占染色體畸變所致出生缺陷的一半。

不僅僅是產前領域，對于一些原因不明、難以判斷的疾病，如果通過CNV-seq來檢測，那么一切可能將變得容易且精準...... 如不明原因的智力障礙、部分癲癇患者、天生身體畸形（心臟畸形、手部畸形等）、面部畸形（五官間距過大、耳鼻異常）、身材矮小、過度生長、染色體核型正常但臨床表型生育障礙的夫妻等。

其次，對于早孕期流產的胚胎和死胎或畸形胎兒做CNV-seq檢測也是十分必要的。因為50~60% 孕早期自然流產由染色體異常造成，做CNV-seq檢測可減少不必要的其他原因尋找。同樣，排查死胎或畸形胎兒的CNV是否異常也有助于明確病因，對于指導再次妊娠非常有意義。

█醫學遺傳實驗室簡介:

自醫學遺傳實驗室成立以來，醫院十分重視遺傳實驗室人才梯隊建設和國際先進設備的投入，擁有高級職稱6人、碩士1人、博士1人。

實驗室擁有ABI3500一代測序儀、NextSeq CN500高通量測序儀、ABI?StepOnePlus熒光定量PCR儀、Biometra梯度PCR儀、BIO-RAD凝膠成像儀、北昂全自動染色體掃描系統、高效液相色譜串聯質譜儀、全自動熒光免疫分析儀、Sebia毛細管電泳儀、PerkinElmer時間分辨熒光免疫分析儀等先進設備。

醫學遺傳學實驗室主要承擔著為臨床提供遺傳病診篩的技術支持，包括產前遺傳病篩查診斷及新生兒疾病篩查。能獨立開展CNV-seq、STR母源污染鑒定、地中海貧血篩查及基因檢測、脊髓性肌肉萎縮癥基因檢測、無創胎兒游離DNA檢測、耳聾基因、染色體核型培養及分析，唐氏篩查檢測，新生兒疾病篩查、串聯質譜遺傳代謝病篩查等二十余種檢測項目。

豐富遺傳病臨床診斷技術、提高遺傳病診斷效率是醫學遺傳學實驗室承載的使命。積極致力于國內外先進技術的引進，這也是實驗室建設和發展的必經之路。日后將開展X脆性檢測、葉酸關鍵酶基因檢測、耳聾基因、G6pD基因檢測等。

醫學遺傳實驗室與產前遺傳咨詢、超聲篩查組成產前診斷中心。中心自2002年開始開展產前診斷工作，2007年取得“母嬰保健技術服務”（產前診斷）資質，2008年9月成為廣東省產前診斷機構，綜合開展遺傳咨詢、產前篩查、醫學影像、生化免疫、細胞遺傳等項目，同時，與其它單位合作開展分子遺傳項目，是順德區唯一一家具有產前診斷資質的醫療機構。（覃海妮 通訊員黃欣英）